Томас Андерсон живет размеренной жизнью успешного разработчика видеоигр, создавая культовые проекты. Однако его повседневная рутина омрачена жуткими образами и странными воспоминаниями, которые он объясняет как побочные эффекты, принимая ежедневные голубые таблетки. Его окружение убеждает его, что это просто продукт его разыгравшегося воображения. В один день, мир Томаса переворачивается с ног на голову благодаря Багз — загадочной хакерше, которая открывает перед ним возможность существования иллюзорной реальности вокруг него. Она уверена, что окружающий мир не более чем искусно созданная обманка. Вдохновленный ее решительностью, Томас оказывается перед выбором: продолжать жить в привычной оболочке или рискнуть узнать правду за границами видимого. Призраки прошлого становятся все более ощутимыми, заставляя его задуматься: а что если мифическая Матрица не исчезла, а ждет своего возвращения? Реальность Томаса начинает распадаться, и ему предстоит вновь столкнуться с тайнами, которые могут изменить его восприятие мира навсегда.