После веселого медового месяца Шрэк и Фиона возвращаются к своему тихому болоту, но внезапно получают письмо от родителей Фионы — они приглашены в королевство Далеко-Далеко. Родители Фионы ещё не знают, что их дочь осталась огром, и тем более не подозревают, кто её супруг. Несмотря на сомнения, Шрэк, поддерживая Фиону, соглашается на поездку. В путешествии их сопровождает веселый Ослик.
По прибытии в замок выясняется, что отец Фионы недоволен выбором дочери и планирует избавиться от нежеланного зятя. Он заключает договор с хитрым наёмником, Котом в сапогах, который должен устранить Шрэка. Тем временем, Фея-Крёстная строит свои коварные планы, чтобы её сын, Прекрасный Принц, женился на принцессе.
Шрэк и его друзья оказываются втянутыми в запутанный водоворот событий, где им предстоит проявить находчивость и стойкость. По мере развития событий герои понимают, что истинная любовь и настоящая дружба не зависят от внешних различий, а иногда поддержку можно найти в самых неожиданных местах.