После событий в Мишн-Сити прошло два года, и Сэм Уитвикки жаждет спокойной студенческой жизни. Он готовится к колледжу, стремясь к обычным занятиям и новым знакомствам, однако его прошлое не отпускает его настолько легко. Бамблби, с которым Сэму пришлось попрощаться, неохотно расстаётся с ним, а Автоботы продолжают тайное сотрудничество с вооружёнными силами, пока опасность ещё витает в воздухе.
Десептиконы, оправившись от поражения, разрабатывают новый план, угрожающий балансу во Вселенной. В это время у Сэма начинают проявляться странные видения и загадочные символы, которые тревожат его ум. Эти мистические знаки оказываются ключом к древним тайнам Кибертрона, вовлекая его в неожиданные события, от которых зависит будущее Земли.
Сэм стоит перед выбором: остаться простым студентом или вновь вступить в опасную игру, став частью войны, которая может изменить судьбу человечества навсегда. Смогут ли он и его союзники предотвратить грядущую катастрофу?